不同於傳統檢測基因拷貝數的方法,TaqMan® Copy Number Assays僅需幾小時的時間,即可完成大量樣本的偵測,運用mutiplex QPCR的方式,以一對沒有標記的引子及一段5’端標記FAM™螢光的探針偵測目標基因,並同時加入另一對沒有標記的引子及一段5’端標記VIC ®螢光3’端標記TAMRATM螢光作為Quencher的探針,偵測2X參考基因,Applied Biosystems已設計好的2X參考基因包含Human RNase P及TERT、mouse Tfrc及Tert可供選用,建議選用與目標基因較遠的參考基因,搭配TaqMan® Genotyping Master Mix進行實驗,實驗結果Applied Biosystems提供免費輔助軟體CopyCaller® Software。